南方科技大学大陆招生同香港城市大学、香港中文大学一样，被安排在本科提前批录取。与港校不同的是，南科大招生模式为高考成绩占总成绩的60%，学校复试成绩占30%，剩余10%是考生高中阶段的平时成绩。据南科大招生组工作人员马冬梅介绍，南科大教改的重大方向是改变了传统高考“一考定终生”可能产生的偏差，招生向农村、非重点中学倾斜，让一些有天赋或教育资源薄弱地区的考生，也能获得优质的高教资源。